要评估万方论文查重系统的安全性，首先需要进行系统漏洞扫描，包括对系统的网络安全、数据传输安全、用户身份验证等方面进行全面检测。其次，进行安全性评估测试，模拟各种攻击手段，验证系统的抗攻击能力。同时，加强系统的权限管理，确保只有授权用户可以访问敏感信息。另外，定期更新系统补丁，加强系统的安全防护措施，保障系统安全运行。

除此之外，还可以采用安全加固技术，包括加密传输、访问控制、安全审计等手段，提高系统的安全性。另外，建立安全事件响应机制，及时发现并处理系统安全漏洞，防止安全事件扩大。同时，加强对系统日志的监控和分析，及时发现异常行为。综合利用以上方法，可以全面评估万方论文查重系统的安全性，确保系统稳定、安全运行。